南方医科大学是全国重点大学，前身为中国人民解放军第一军医大学，2004年8月整体移交广东省，是广东省首批5所省属高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校、全国首批“部委省”共建医科高校、全国首批开设八年制临床医学专业（本博连读）的8所高校之一，拥有5个国家重点及培育学科、6个国家中医药管理局重点学科、10个广东省重点学科；14个学科入围ESI全球前1%，其中临床医学入围全球前0.5‰、药理学与毒理学入围ESI全球前1‰，ESI总体排名位居全国第46。

南方医科大学重视科技创新，以建设世界一流的医科大学为发展目标。现有国家重点实验室、国家临床医学研究中心、粤港澳大湾区脑与类脑研究中心等国家和省部级科研平台116个，科技部重点领域创新团队2个、教育部创新团队2个、国家自然科学基金创新研究群体1个。共获国家科技三大奖29项，省部级一等奖55项，获国家科技奖数量位居广东省属高校第一。2023年，获国家自然科学基金442项，立项数位居全国高校第16位、全国独立医科院校首位、广东省高校第2位，连续8年跻身全国30强。附属南方医院国家基金立项数连续3年位列全国医疗机构前10，其中最好成绩为全国医疗机构第3位、广东省医疗机构第1位。2023年获中国博士后科学基金115项，位列全国高校第13、独立医科院校第1。2023年，学校申请专利469项，其中发明专利348项，授权专利569项，其中发明专利292项；开展横向课题587项，合同金额达24151.32万元；完成19项科技成果转化，合同金额达3573.9万元。

南方医科大学科技园成立于2008年，2021年6月被认定为国家大学科技园，是服务学校科技成果转移转化、区域经济建设发展的重要平台，园区位于学校广州校区内，可自主支配场地面积达1.5万平方米，构建了涵盖孵化创新、技术转移、投资融资等方面的公共服务体系。近5年来，大学科技园依托学校雄厚科研实力，积极与政府、企业及相关服务机构协同合作，累计孵化、培育了200余家生物医药大健康领域科技创新型企业。