南方医科大学顺德校区位于珠三角区域性中心城市、岭南滨水城市，历史文化氛围浓厚的佛山市顺德区（原顺德市）。校区建筑风格独特，具有浓郁的中国古典园林特色。为记叙新校区建设之历史，学校撰《顺德新园记》刻于大门照壁：“顺德新园，幽雅俊美，格局别致。北揽容桂山水，南拥书馆风华，东植百草,西沐德辉。有重楼飞阁，碧瓦红墙，引清溪畅流，穿池绕苑，望虹桥烟雨，香山入画。紫荆坛嫣然照水，凌云塔直上九霄。荷亭扶香，兰亭熏风，碧云流转，白鹭纷飞。冬岭朝阳暖，景湖明月生。风拂芙蓉，烟笼牡丹，芝兰吐蕊，桃李含芳。劲节看翠竹，浩气养青松。秋实堂培累累硕果，春华堂听朗朗书声。水润宜耘业，山远澹人心。凝思径深处，展怀天地间。待到花开时节，香传四海，俊杰咸集，人才辈出。自在其间，幸甚至哉”。顺德校区既是学生治学修身的乐园，也是教书育人的理想之所。

顺德校区现占地面积120万平方米（1800亩），首期工程项目建筑面积22万平方米，包含教学核心区、行政办公区、运动区、产业发展区、生活服务区和生态湿地区。教学硬件设施十分完善，有教学楼、实验楼各五幢，现代化多媒体教室、实验室200余间，藏书100万册图书馆1座，可满足12000学生的教学任务。运动设施场地齐全，建有多功能室内综合体育馆、标准游泳池、田径运动场和足球场，另设有多个室外篮球场、羽毛球场、网球场和毽球场。校区内生活设施一应俱全，建有大型超市、银行、邮局、书店以及理发室、面包房。交通便利，顺德区内三条公交路线直达校区总站。

顺德校区与广州校本部实行教学一体化，学生一、二年级在校区学习，三、四、五年级回广州校本部学习。学校在顺德校区设立管委会，代表学校负责顺德校区的全面工作，保障校区正常的教学、生活秩序，维护校区安全、稳定、文明、和谐的良好局面。