一、基本信息
姓名：周基元
职称：教授
联系邮箱：zhoujiyuan5460@sina.com
二、学习经历
1994.4-1996. 6 中国人民解放军国防科技大学，数学专业，学士
2002.9-2005.3 东南大学，概率论与数理统计专业，硕士
2006.1-2009.9 香港大学，统计学与遗传学专业，博士
三、拟招收博士后开展的研究方向
1. 统计遗传学方法及软件开发研究；
2. 生物统计学方法及其在医学、公共卫生等领域的应用研究；
3. 因果推断、孟德尔随机化方法及其应用研究；
4. 大数据分析（机器学习、可解释机器学习、深度学习）。
四、主要学术任职
1. SCI期刊《BMC Genomics》，副编辑；
2. 中华预防医学会生物统计分会，委员；
3. 中国卫生信息与健康医疗大数据学会统计理论与方法专业委员会，委员；
4．中国医药教育协会医药统计专业委员会，委员；
5．多器官损伤防治全国重点实验室，PI。
五、主要获奖情况
1. 2006年11月获得由美国国家卫生研究院National Institute of General Medical Sciences 提供的1000美金奖学金；
2. 2006年11月获得由香港Bioinformatics Subtheme of the SRT on Genomics, Proteomics and Bioinformatics提供的3000港币奖学金。
六、主要研究项目
1.基于家系和独立个体混合数据的精准定位X染色体数量性状位点统计方法研究，广东省自然科学基金面上项目，项目负责人，基金编号：2023A1515011242，资助总金额：10万元，资助时间：2023年1月至2025年12月。
2. X染色体偏倚失活系数的稳健估计及不同失活模式下有效的复杂疾病易感基因定位的统计方法研究，国家自然科学基金面上项目，项目负责人，基金编号：2021年（82173619），资助总金额：71.5万元（其中直接经费：55万元），资助时间：2022年1月至2025年12月。
3. X染色体失活的统计度量及合并X染色体失活与印记效应的关联分析研究，国家自然科学基金面上项目，项目负责人，基金编号：2017年（81773544），资助总金额：66万元（其中直接经费：55万元），资助时间：2018年1月至2021年12月。
4. VP1蛋白A289T变异、VIM多态性与EV71神经系统感染的相关性和机制研究，国家自然科学基金面上项目，第一参与人，基金编号：2015年（81573207），资助金额：68.4万元，资助时间：2016年01至2019年12月。
5. X 伴性遗传病印记效应检测及其关联分析的统计方法研究，国家自然科学基金面上项目，项目负责人，基金编号：2013年（81373098），资助金额：65万元，资助时间：2014年1月至2017年12月。
6.印记基因检测及基于印记效应的疾病易感基因定位的统计方法研究，国家自然科学基金面上项目，项目负责人，基金编号：2010年（81072386），资助金额：34万元，资助时间：2011年1月至2013年12月。
7. X染色体上定位致病印记基因的统计方法研究，广东省科技计划项目，项目负责人，基金编号：2013B021800038，资助时间：2013年12月至2016年11月，资助金额：5万元。
8. HWD下单倍型频率估计方法研究，南方医科大学高层次人才引进启动基金，资助金额：5万元，资助时间：2010年3月至2011年4月。
9.带干扰的广义复合泊松风险模型研究，湖南省教育厅资助项目，第一参与者，基金编号：08C667，资助时间：2009年至2010年。
七、代表性论文
[1] Qi Zhong#, Hao-Wen Chen#, Shun Zhang, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者), Xian-Bo Wu*. Reply to: “Reassessing the causal association between frailty and chronic liver disease: Evidence from genetic analyses”. Journal of Hepatology. 2025, 82(3): e126-e127 DOI: doi.org/10.1016/j.jhep.2024.10.034. [PubMed] (2023年影响因子：26.8, SCI小类一区期刊)
[2] Yifang Wei#, Yi Zhang#, Yuansheng Li, Fanshuo Meng, Ruixiang Zhang, Zuming You, Chenxi Xie and Jiyuan Zhou*（通讯作者）, Trajectories of Cognitive Change and Their Association with All-Cause Mortality Among Chinese Older Adults: Results from the Chinese Longitudinal Healthy Longevity Survey. Behavioral Sciences, 2025, 15(3): 365. DOI: doi.org/10.3390/bs15030365. (2023年影响因子：2.5 )
[3] Jingkai Wang, Qiu-Wen Zhu, Jia-Hao Mai, Shun Zhang, Yuqing Wang, Jiatong Liang, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). A multi-omics study of brain tissue transcription and DNA methylation revealing the genetic pathogenesis of ADHD. Briefings in Bioinformatics. 2024, 25(6):bbae502. DOI: 10.1093/bib/bbae502. [PubMed] (2023年影响因子：6.8, SCI小类一区期刊)
[4] Yi-Fan Kong#, Shi-Zhu Li#, Kai-Wen Wang, Bin Zhu, Yu-Xin Yuan, Meng-Kai Li, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). An Efficient Bayesian Method for Estimating the Degree of the Skewness of X Chromosome Inactivation Based on the Mixture of General Pedigrees and Unrelated Females. Biomolecules. 2023, 13(3): 543. DOI: 10.3390/biom13030543. [Software: BEMXCIS] [PubMed] (2022年影响因子：5.5)
[5] Kai-Wen Wang#, Yu-Xin Yuan#, Bin Zhu#, Yi Zhang,Yi-Fang Wei, Fan-Shuo Meng, Shun Zhang, Jing-Xuan Wang, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). X chromosome-wide association study of quantitative biomarkers from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative Study. Frontiers in Aging Neuroscience. 2023, 15:1277731. DOI: 10.3389/fnagi.2023.1277731. [PubMed] (2022年影响因子：4.8)
[6] Peizhen Zhao, Ziying Yang, Ye Zhang, Jinmei Chen, Xuezhen Fu, Weiming Tang*, Jiyuan Zhou*(共同通讯作者). Prevalence of syphilis and risk factors among HIV-positive men who have sex with men in Guangdong province. Frontiers in Public Health. 2022, 10:1025221. DOI: 10.3389/fpubh.2022.1025221. [PubMed] (2021年影响因子：6.461)
[7] Zi-Ying Yang#, Wei Liu#, Yu-Xin Yuan#, Yi-Fan Kong, Pei-Zhen Zhao, Wing K. Fung*, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者). Robust association tests for quantitative traits on the X chromosome. Heredity. 2022, 129(4):244–256. DOI: 10.1038/s41437-022-00560-y. [PubMed] [Software: QMVtest] (2021年影响因子：3.832，SCI遗传学小类二区期刊)
[8] Wen-Yi Yu#, Yu Zhang#, Meng-Kai Li, Zi-Ying Yang, Wing Kam Fung, Pei-Zhen Zhao and Ji-Yuan Zhou*(通讯作者) BEXCIS: Bayesian methods for estimating the degree of the skewness of X chromosome inactivation. BMC Bioinformatics. 2022, 23:193. DOI: 10.1186/s12859-022-04721-y. [Software: BEXCIS] [PubMed] (2021年影响因子：3.307，SCI数学与计算生物学小类二区期刊)
[9] Meng-Kai Li#, Yu-Xin Yuan#, Bin Zhu, Kai-Wen Wang, Wing Kam Fung and Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). Gene-based methods for estimating the degree of the skewness of X chromosome inactivation. Genes. 2022, 13(5):827. DOI: 10.3390/genes13050827. [Software: GEXCIS] [PubMed] (2021年影响因子：4.141)
[10] Yi-Fan Kong#, Meng-Kai Li#, Yu-Xin Yuan, Zi-Ying Yang, Wen-Yi Yu, Pei-Zhen Zhao and Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). Detection of Parent-of-Origin Effects for the Variants Associated with Behavioral Disinhibition in the MCTFR Data. Frontiers in Genetics. 2022, 13: 831685. DOI: 10.3389/fgene.2022.831685. [PubMed] (2021年影响因子：4.772)
[11] 孔艺凡，李锦，周基元*（通讯作者）. 基于家系数据合并X染色体失活的数量性状关联分析方法研究. 中国卫生统计. 2022,39(5):659-662+668. DOI: 10.3969/j.issn.1002-3674.2022.05.004.
[12] Peizhen Zhao, Ziying Yang, Baohui Li, Mingzhou Xiong, Ye Zhang, Jiyuan Zhou*(共同通讯作者), Cheng Wang*. Simple-to-use nomogram for predicting the risk of syphilis among MSM in Guangdong Province: results from a serial cross-sectional study. BMC Infectious Diseases. 2021, 21:1199. DOI: https://doi.org/10.1186/s12879-021-06912-z [PubMed] (2021年影响因子: 3.667)
[13] Pei Zhen Zhao, Ya Jie Wang, Huan Huan Cheng,Ye Zhang, Wei Ming Tang, Fan Yang, Wei Zhang, Ji Yuan Zhou*(共同通讯作者), Cheng Wang*. Uptake and Correlates of Chlamydia and Gonorrhea Testing among Female Sex Workers in Southern China: A Cross-sectional Study. BMC Public Health. 2021, 21:1477. [PubMed] (2021年影响因子: 4.135)
[14] Bao-Hui Li#, Wen-Yi Yu#, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). A statistical measure for the skewness of X chromosome inactivation for quantitative traits and its application to the MCTFR data. BMC Genomic Data. 2021, 22:24. [PubMed] (期刊原名BMC Genetics, 2021年影响因子: 2.759)
[15] 杨梓滢, 余雯薏, 张玉, 周基元*(通讯作者). 一种基于MOVER法中介效应置信区间的构造方法. 中国卫生统计. 2021, 38(2): 204-207+214.
[16] Yu Zhang#, Si-Qi Xu#, Wei Liu, Wing Kam Fung, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). A robust test for X-chromosome genetic association accounting for X-chromosome inactivation and imprinting. Genetics Research. 2020, 102:e2,1-12. DOI: 10.1017/S0016672320000026. (2020年影响因子: 1.167)
[17] Peng Wang, Si-Qi Xu, Bei-Qi Wang, Wing K. Fung*, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者). A robust and powerful test for case-control genetic association study on X chromosome. Statistical Methods in Medical Research. 2019, 28(10-11): 3260-3272. [Full Text] [Software:Zmax] (2018年刊物影响因子：2.388，SCI一区)
[18] Zhijiang Liang, Yin Yang, Jin Li, Xinhong Zhu, Zengliang Ruan, Shuilian Chen, Guanhao Huang, Hualiang Lin*, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者), Qingguo Zhao*. Migrant population is more vulnerable to the effect of air pollution on preterm birth: results from a birth cohort study in seven Chinese cities. International Journal of Hygiene and Environmental Health. 2019, 222(7): 1047-1053. DOI: 10.1016/j.ijheh.2019.07.004. [Full Text] [PubMed] (2018年影响因子: 4.379, SCI二区)
[19] Peng Wang#, Yu Zhang#, Bei-Qi Wang, Jian-Long Li, Yi-Xin Wang, Dongdong Pan, Xian-Bo Wu, Wing Kam Fung, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). A statistical measure for the skewness of X chromosome inactivation based on case-control design. BMC Bioinformatics. 2019, 20:11. DOI: 10.1186/s12859-018-2587-2 [Full_Text] [Software: SkewXCI] (2018年影响因子：2.511，SCI二区)
[20] Wei Liu, Bei-Qi Wang, Guojun Liu-Fu, Wing Kam Fung*, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者). X-chromosome genetic association test incorporating X chromosome inactivation and imprinting effects. Journal of Genetics. 2019, 98:99. DOI: 10.1007/s12041-019-1146-6. [Full Text] (2018年影响因子：0.825)
[21] Pui Yin Lau#, Kar Fu Yeung#, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者), Wing Kam Fung*. Two powerful tests for parent-of-origin effects at quantitative trait loci on X chromosome. Human Heredity. 2017/2018, 83(5): 250–273 as DOI: 10.1159/000496987. [Full Text] [Software] (2018年影响因子: 0.556)
[22] Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者), Xiao-Ping You, Ran Yang, Wing K Fung*. Detection of imprinting effects for qualitative traits on X chromosome based on nuclear families. Statistical Methods in Medical Research. 2018, 27(8): 2329-2343. [Full Text] (2018年刊物影响因子：2.388，SCI一区)
[23] Zhijiang Liang#, Peng Wang#, Qingguo Zhao, Bei-Qi Wang, Yuanzhu Ma, Hualiang Lin, Jianpeng Xiao, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者). Effect of the 2008 cold spell on preterm births in two subtropical cities of Guangdong Province, Southern China. Science of the Total Environment. 2018, 642:307–313. [Full Text] (2018刊物影响因子: 5.589，SCI二区)
[24] Wing K Fung, KexinYu, Yingrui Yang, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者）. Efficient Monte Carlo evaluation of resampling-based hypothesis tests with applications to genetic epidemiology. Statistical Methods in Medical Research. 2018, 27(5): 1437-1450. [Full Text] (2018年刊物影响因子：2.388，SCI一区)
[25] Qi-Lei Zou#, Xiao-Ping You#, Jian-Long Li, Wing Kam Fung*, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者). A powerful parent-of-origin effects test for qualitative traits on X chromosome in general pedigrees. BMC Bioinformatics. 2018, 19:8 as doi: 10.1186/s12859-017-2001-5. [Full Text] (2018年刊物影响因子：2.511， SCI二区)
[26] Si-Qi Xu, Yu Zhang, Peng Wang, Wei Liu, Xian-Bo Wu*, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者). A statistical measure for the skewness of X chromosome inactivation based on family trios. BMC Genetics. 2018, 19: 109. doi: 10.1186/s12863-018-0694-8 [Full_Text] (2018年影响因子: 2.547)
[27] 王北琪，汪鹏，尹平，周基元*（通讯作者）. 偏态分布下多样本变异系数比较的平方秩检验. 中国卫生统计. 2018, 35(4): 515-517.
[28] Jian-Long Li, Peng Wang, Wing Kam Fung*, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者). Generalized disequilibrium test for association in qualitative traits incorporating imprinting effects based on extended pedigrees. BMC Genetics. 2017, 18:90 as doi: 10.1186/s12863-017-0560-0. [Full Text] [Software: MCGDTI] (2016年刊物影响因子：2.266)
[29] Kexin Yu, Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者), Wing K Fung*. Detection of imprinting effects for quantitative traits on X chromosome using nuclear families with multiple daughters. Annals of Human Genetics. 2017, 81(4): 147-160. [Full Text] (2016年刊物影响因子：1.659)
[30] Xiao-Ping You, Qi-Lei Zou, Jian-Long Li, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者）. Likelihood Ratio Test for Excess Homozygosity at Marker Loci on X Chromosome. PLoS ONE. 2015, 10(12):e0145032. doi:10.1371/journal.pone.0145032. [Full Text] [Software:XHWE]（SCI收录，2014年刊物影响因子：3.234).
[31] Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者）, Hai-Qiang He, Xiao-Ping You, Shao-Zhan Li, Ping-Yan Chen, and Wing Kam Fung*. A powerful association test for qualitative traits incorporating imprinting effects using general pedigree data. Journal of Human Genetics. 2015, 60(2):77-83. [Full Text] [Software: MCPDTI]（SCI收录，2014年刊物影响因子：2.462).
[32] 李剑龙，陈方尧，李丹玲，周基元*（通讯作者），陈平雁．具有相关关系的灵敏度和特异度的Monte Carlo模拟方法研究．中国卫生统计．2015, 32(3):417-420.
[33] Hai-Qiang He, Wei-Gao Mao, Dongdong Pan, Ji-Yuan Zhou*(通讯作者）, Ping-Yan Chen, and Wing Kam Fung. Detection of parent-of-origin effects for quantitative traits using general pedigree data. Journal of Genetics. 2014, 93(2):339-347. [Full Text] [Software: Q-MCPPAT]（SCI收录，2013年刊物影响因子：1.013).
[34] 汪鹏，周基元*（通讯作者）．非中心t分布非中心参数的最大似然估计．统计与决策．2014，第15期，9-13页.
[35] Wei-Gao Mao, Hai-Qiang He, Yan Xu, Ping-Yan Chen, and Ji-Yuan Zhou*(通讯作者）. Powerful Haplotype-Based Hardy-Weinberg Equilibrium Tests for Tightly Linked Loci. PLoS ONE. 2013, 8(10):e77399. doi:10.1371/journal.pone.0077399. [Full Text] [Software:HAP-HWE]（SCI收录，2012年刊物影响因子：3.73).
[36] 汪鹏，周怡，周基元*（通讯作者）．多样本变异系数比较的似然比检验．中国卫生统计．2013, 30(3):317-322.
[37] Ji-Yuan Zhou*(共同通讯作者), Wei-Gao Mao, Dan-Ling Li, Yue-Qing Hu*, Fan Xia, and Wing Kam Fung. A Powerful Parent-of-Origin Effects Test for Qualitative Traits Incorporating Control Children in Nuclear Families. Journal of Human Genetics. 2012, 57(8):500-507. [Abstract] [Software:C-PATu]（SCI收录，2011年刊物影响因子：2.57).
[38] Feng He, Ji-Yuan Zhou(通讯作者、共同第一作者), Yue-Qing Hu, Fengzhu Sun, Jingyuan Yang, Shili Lin, and Wing Kam Fung. Detection of Parent-of-Origin Effects for Quantitative Traits in Complete and Incomplete Nuclear Families With Multiple Children. American Journal of Epidemiology. 2011, 174(2):226-233. [Full Text] [Software:Q-C-PAT]（SCI收录，2010年刊物影响因子：5.745).
[39] Ji-Yuan Zhou, Jie Ding, Wing K. Fung, and Shili Lin. Detection of parent-of-origin effects using general pedigree data. Genetic Epidemiology. 2010, 34(2):151-158. [软件:MC-PDT] （SCI收录，2010年刊物影响因子：3.09).
[40] Ji-Yuan Zhou, Shili Lin, Wing K. Fung, and Yue-Qing Hu. Detection of parent-of-origin effects in complete and incomplete nuclear families with multiple affected children using multiple tightly linked markers. Human Heredity. 2009, 67(2):116-127.（SCI收录，2009年刊物影响因子：3.806）.
[41] Ji-Yuan Zhou, Yue-Qing Hu, Shili Lin, and Wing K. Fung. Detection of parent-of-origin effects based on complete and incomplete nuclear families with multiple affected children. Human Heredity. 2009, 67(1):1-12.（SCI收录，2009年刊物影响因子：3.806）.
[42] Ji-Yuan Zhou, Yue-Qing Hu, and Wing K. Fung. A simple method for detection of imprinting effects based on case-parents trios. Heredity. 2007, 98(2):85-91. （SCI收录，2007年刊物影响因子：3.823）.
