南方医科大学药学院是原第一军医大学转制移交广东省后，于2005年6月成立的学院。2010年1月始，学院全面试行学术负责人制（PI制），2014年9月，成为南方医科大学首批 “试点学院”之一。2020年1月1日起，全院实施第三轮PI制和新型本科教学管理体制。

学院秉承“创新引领发展，特色成就卓越”的理念，以特色内涵建设、教学模式改革、多元协同创新发展以及体制机制创新“四位一体”的改革目标为使命，更新理念，整合资源，汇聚人才，为跻身中国高校最优秀的药学院行列而奋斗。

学院设有8个创新群体，1个本科教学工作部，2个本科学系、9个教学团队、3个支撑中心。拥有药学一级学科博士后科研流动站，药学一级学科博士、硕士学位授权点，药学硕士专业学位授权点以及药学（四年制）和临床药学（五年制）两个本科专业。药学专业为广东省名牌特色专业，2019年10月通过教育部药学专业认证，2020年获批国家首批一流本科专业建设点，临床药学专业2021年获批教育部国家一流本科专业建设点。学院建有全国药学专业学位研究生培养示范基地和2个广东省教学示范中心。现有国家药监局药物代谢研究与评价重点实验室、广东省新药筛选重点实验室、粤港澳新药筛选联合实验室等省部级以上科研平台8个。

药学院现有正式在编人员103人，专任教师82人，其中：正高35人，副高32人，中级15人；研究生导师56人，其中博士生导师28人；具有博士学位教师占专任教师总数91.4%，具有留学背景的教师占比55.6%。拥有国家杰出青年科学基金获得者、国家特支计划“科技创新”领军人才、国家百千万人才工程“有突出贡献中青年专家”、国家特支计划青年拔尖人才、国家海外高层次人才、国家优秀青年科学基金获得者、国家重大人才工程青年学者等国家级人才16人次；广东省“珠江学者”、特支计划“百千万工程”人才、广东省杰出青年基金获得者、南粤优秀教师等省级人才23人次；广州市“珠江科技新星”等市级人才14人次。有10余名教师在国家级学术团体任职，包括中国药理学会抗炎免疫药理专业委员会主任委员、中国药理学会临床药理专业委员会副主任委员、中国药理学会分析药理学专业委员会副主任委员、中国药理学会药物代谢专业委员会副主任委员等。

近年来（2016年-2023年），学院先后承担了国家科技重大专项、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金区域创新发展联合基金重点支持项目、广东省“新药创制”科技重大专项、广东省重点领域研发计划等国家、省市级课题350余项，研究经费达2.1亿元。在Hepatology、Nat Commun、Sig Transduct Target Ther、Angew Chem Int Ed、Adv Sci、Adv Mater、J Med Chem、Brit J Pharmacol等国际著名期刊上发表了SCI论文1100余篇，申请国家发明专利、国际PCT专利203项，获得授权160项。获广东省药理学会科技成果奖二等奖1项、广东省丁颖科技奖1项，获“霍英东教育基金会第18届高等院校教育教学奖”二等奖1项，获广东省教育教学成果奖二等奖1项，获省级及以上教育研究项目30项，发表教学论文89篇，编写教材44部，其中主编、副主编21部。

2024年11月，药理与毒理学学科ESI位居全球第55名，进入全球前万分之五，排名全球前0.411‰，化学学科ESI排名全球前0.442%，材料科学学科ESI排名全球前0.327%。

（更新时间：2024年11月）