教授，博士生导师

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个人简介：

艾珊珊，南方医科大学基础医学院教授，博士生导师。2020年博士毕业于北京大学，师从何爱彬教授，研究兴趣为单细胞新技术开发、发育和疾病过程中细胞命运决定的表观遗传调控机制解析。利用小鼠和类器官模型，结合细胞生化，分子生物学及生物信息学手段，研究内容涵盖组织器官发育及再生，疾病发生及分子谱系示踪等。作为第一或通讯作者（包括共同）在学术杂志Nature Cell Biology，Developmental Cell，Molecular Cell，Circulation, The Journal of Clinical Investigation，Circulation Research等发表学术论文10余篇。主持国家重点研发计划青年项目，国家自然科学基金项目面上及青年项目，广东省杰出青年科学基金项目等。

研究方向：

单细胞新技术开发、发育和疾病过程中细胞命运决定的表观遗传调控机制解析

研究关键词

细胞命运，单细胞多组学技术，胚胎发育，表观调控

Cell fate; Single-cell multiomics; Embryo development; Epigenetic regulation

代表性论著

1. Yang H^#, Zhong Y^#, Guo W^#, Guo W, Chen B, Lin Z, Zhang Q, Zou R, Cao X, Li F, Feng W, Yan J, Zeng Z, Wang W, Ouyang K, Xu X, Fan X, Fang X, Ai S*, Liu C*. TAX1BP3 Is a SUMOylated Nucleocytoplasmic Shuttling Protein and Protects Against Vascular Neointimal Hyperplasia [J]. Circulation, 2025. (IF= 38.6, JCR 1区，共同通讯作者)

2. Fu M^#, Jia S^#, Xu L^#, Li X, Lv Y, Zhong Y, Ai S*. Single-cell multiomic analysis identifies macrophage subpopulations in promoting cardiac repair [J]. J Clin Invest, 2024. (IF= 13.6, JCR 1区，唯一通讯作者)

3. Chen Y^#, Ye X^#, Zhong Y^#, Kang X, Tang Y, Zhu H, Pang C, Ning S, Liang S, Zhang F, Li C, Li J, Gu C, Cheng Y, Kuang Z, Qiu J, Jin J, Luo H, Fu M, Hui H X, Li L, Ruan D, Liu P, Chen X, Sun L*, Ai S*, Gao X*. SP6 controls human cytotrophoblast fate decisions and trophoblast stem cell establishment by targeting MSX2 regulatory elements [J]. Dev Cell, 2024, 59(12): 1506-22 e11. (IF=8.7, JCR 1区，共同通讯作者)

4. Fu M^#, Pang L^#, Wu Z, Wang M, Jin J*, Ai S*, Li X*. Single-cell multi-omics delineates the dynamics of distinct epigenetic codes coordinating mouse gastrulation [J]. BMC Genomics, 2025, 26(1): 454. (IF= 3.7, JCR 2区，共同通讯作者)

5. Zhang J^#, Li CC^#, Li X, Liu Y, Wang Q, Zhang G, Xiong H, He A*, Ai S*. Novel enhancers conferring compensatory transcriptional regulation of nkx2-5 in heart development. iScience. 2023;26:106509. (IF=4.6, 最后通讯作者)

6. Ai S^#, Xiong H^#, Li CC, Luo Y, Shi Q, Liu Y, Yu X, Li C, He A*. Profiling chromatin states using single-cell itchip-seq. Nature cell biology. 2019;21:1164-1172. (IF=20.04, JCR 1区，第一作者)

7. Wang Q^#, Xiong H^#, Ai S^#, Yu X^#, Liu Y^#, Zhang J, He A*. Cobatch for high-throughput single-cell epigenomic profiling. Molecular Cell. 2019;76:206-216. (IF=15.58, JCR 1区，共同第一作者)

8. Li Y^#, Ai S^#, Yu X^#, Li C, Li X, Yue Y, Wei Y, Li CY*, He A*. Replication-independent histone turnover underlines the epigenetic homeostasis in adult heart. Circulation research. 2019:198-208. (IF=14.47, JCR 1区，共同第一作者)

9. Ai S^#, Yu X^#, Li Y^#, Peng Y, Li C, Yue Y, Tao G, Li C, Pu WT, He A*. Divergent requirements for ezh1 in heart development versus regeneration. Circulation research. 2017;121:106-112. (IF=14.47, JCR 1区，第一作者)

10. Ai S^#, Peng Y^#, Li C, Gu F, Yu X, Yue Y, Ma Q, Chen J, Lin Z, Zhou P, Xie H, Prendiville TW, Zheng W, Liu Y, Orkin SH, Wang DZ, Yu J, Pu WT*, He A*. Eed orchestration of heart maturation through interaction with hdacs is h3k27me3-independent. Elife. 2017;6:e24570. (IF=7.08, JCR 1区，第一作者)

11. Xiong H^#, Luo Y^#, Yue Y^#, Zhang J, Ai S, Li X, Wang X, Zhang YL, Wei Y, Li H, Hu X, Li C, He A*. Single-cell transcriptomics reveals chemotaxis mediated intra-organ crosstalk during cardiogenesis. Circulation research. 2019:398-410. (IF=14.47, JCR1区)

12. Han X^#, Zhang JJ^#, Liu YX^#, Fan XY, Ai S, Luo YJ, Li X, Jin HW, Luo S, Zheng H, Yue YZ, Chang Z, Yang ZZ, Tang FC, He AB*, Shen XH*. The lncrna hand2os1/uph locus orchestrates heart development through regulation of precise expression of hand2. Development. 2019;146. (IF=5.611, JCR1区)

13. Han X^#, Luo S^#, Peng G^#, Lu JY, Cui G, Liu L, Yan P, Yin Y, Liu W, Wang R, Zhang J, Ai S, Chang Z, Na J, He A, Jing N*, Shen X*. Mouse knockout models reveal largely dispensable but context-dependent functions of lncrnas during development. Journal of molecular cell biology. 2018;10:175-178. (IF=4.00, JCR2区)

代表性课题

1. 国家自然科学基金面上项目，49万元，2026.01-2029.12，在研，主持

2. 国家自然科学基金面上项目，52万元，2023.01-2026.12，在研，主持

3. 国家自然科学基金青年项目，30万，2023.01-2025.12，在研，主持

4. 国家重点研发计划，500万，2022.12-2027.11，在研，主持

5. 国家重点研发计划，120万，2022.12-2027.11，在研，项目骨干

6. 广东省自然科学基金杰出青年项目，100万，2024.01-2027.12，在研，主持

7. 广东省自然科学基金面上项目，10万，2022.01- 2024.12，在研，主持

8. 广州市基础与应用基础研究项目，5万，2022.04-2024.03，在研，主持

9. 广州市科协青年科技人才托举项目，10万，2024.01-2024.12，在研，主持

10. 广州市基础与应用基础研究专题科技菁英“领航”项目，30万，2025.01-2027.12，在研，主持

11. 南方医科大学优青培育项目，20万，2021.07-2023.07，结题，主持

执教课程（课程及教材建设）

生理学

基础医学前言技术与应用

申请专利

1. Abin He, Shanshan Ai, and Chen Li. Micro-ChIP (itChIP) Method. PCT patent number: WO/2019/153852.

2. Abin He, Shanshan Ai, and Yingjie Luo. A Fusion protein for ChIP-seq kit (CoBATCH). PCT patent number: WO/2019/153851.