艾珊珊 教授

发布时间:2020-09-21 浏览次数:

艾珊珊 博士

教授,博士生导师


电子邮件: shanshanai@126.com

电 话: 020-61648603

通讯地址:广东省广州市白云区沙太南路1023号(510515)




个人简介

艾珊珊,博士生导师、博士后合作导师。2020在北京大学获博士学位,同年加入南方医科大学生理学教研室。以第一作者身份在Nature cell biology (2019), Molecular cell (2019), Circulation research (2017, 2019), Elife (2017)等SCI期刊发表5篇原创性论文。开发了两种具有普适性的单细胞ChIP-seq技术,分别为itChIP-seq (indexing and tagmentation-based ChIP-seq)以及CoBATCH (combinatorial barcoding and targeted chromatin release)。


研究方向

主要从事心脏发育和再生的表观调控机制研究,并致力于开发新的单细胞多组学测序技术,利用新开发的单细胞技术解析发育和疾病过程中细胞命运特化的表观遗传机制。


研究关键词

细胞命运,单细胞ChIP-seq,胚胎发育,表观调控

Cell fate; Single cell ChIP-seq; Embryo development; Epigenetic regulation


代表性论著

1. Ai S #, Xiong H#, Li CC, Luo Y, Shi Q, Liu Y, Yu X, Li C, He A*. Profiling chromatin states using single-cell itchip-seq. Nature cell biology. 2019;21:1164-1172. (IF=20.04, JCR1)

2. Wang Q#, Xiong H#, Ai S#, Yu X#, Liu Y#, Zhang J, He A*. Cobatch for high-throughput single-cell epigenomic profiling. Molecular Cell. 2019;76:206-216. (IF=15.58, JCR1)

3. Li Y#, Ai S#, Yu X#, Li C, Li X, Yue Y, Wei Y, Li CY*, He A*. Replication-independent histone turnover underlines the epigenetic homeostasis in adult heart. Circulation research. 2019:198-208. (IF=14.47, JCR1)

4. Ai S#, Yu X#, Li Y#, Peng Y, Li C, Yue Y, Tao G, Li C, Pu WT, He A*. Divergent requirements for ezh1 in heart development versus regeneration. Circulation research. 2017;121:106-112. (IF=14.47, JCR1)

5. Ai S#, Peng Y#, Li C, Gu F, Yu X, Yue Y, Ma Q, Chen J, Lin Z, Zhou P, Xie H, Prendiville TW, Zheng W, Liu Y, Orkin SH, Wang DZ, Yu J, Pu WT*, He A*. Eed orchestration of heart maturation through interaction with hdacs is h3k27me3-independent. Elife. 2017;6:e24570. (IF=7.08, JCR1)

6. Xiong H#, Luo Y#, Yue Y#, Zhang J#, Ai S, Li X, Wang X, Zhang YL, Wei Y, Li H, Hu X, Li C, He A*. Single-cell transcriptomics reveals chemotaxis mediated intra-organ crosstalk during cardiogenesis. Circulation research. 2019:398-410. (IF=14.47, JCR1)

7. Han X#, Zhang JJ#, Liu YX#, Fan XY, Ai S, Luo YJ, Li X, Jin HW, Luo S, Zheng H, Yue YZ, Chang Z, Yang ZZ, Tang FC, He AB*, Shen XH*. The lncrna hand2os1/uph locus orchestrates heart development through regulation of precise expression of hand2. Development. 2019;146. (IF=5.611, JCR1)

8. Han X#, Luo S#, Peng G#, Lu JY, Cui G, Liu L, Yan P, Yin Y, Liu W, Wang R, Zhang J, Ai S, Chang Z, Na J, He A, Jing N*, Shen X*. Mouse knockout models reveal largely dispensable but context-dependent functions of lncrnas during development. Journal of molecular cell biology. 2018;10:175-178. (IF=4.00, JCR2)


代表性课题

1. 国家自然科学基金面上项目,52万元,2023.01-2026.12,在研,主持

2. 国家自然科学基金青年项目,30万,2023.01-2025.12,在研,主持

3. 国家重点研发计划,500万,2022.12-2027.11,在研,主持

4. 国家重点研发计划,120万,2022.12-2027.11,在研,项目骨干

5. 广东省自然科学基金面上项目,10万,2022.01- 2024.12,在研,主持

6. 广州市基础与应用基础研究项目,5万,2022.04-2024.03,在研,主持

7. 南方医科大学优青培育项目,20万,2021.07-2023.07,在研,主持


执教课程(课程及教材建设)

生理学

基础医学前言技术与应用


申请专利

1. Abin He, Shanshan Ai, and Chen Li. Micro-ChIP (itChIP) Method. PCT patent number: WO/2019/153852.

2. Abin He, Shanshan Ai, and Yingjie Luo. A Fusion protein for ChIP-seq kit (CoBATCH). PCT patent number: WO/2019/153851.

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