张镇海 博士
教授,博士生导师
海外高层次引进人才
电子邮件:zhenhaismu@163.com
通讯地址:广东省广州市白云区沙太南路1023号(510515)
个人简介
2011年美国宾州州立大学获生物信息学博士,曾在美国哥伦比亚大学和NIH疫苗研究中心任博士后研究员近三年 。2014年获中组部海外高层次引进人才称号,中国生物工程学会生物信息分会副主任委员。归国以来致力于免疫组库测序技术开发及其在自身免疫疾病、肿瘤、大健康领域的科研及应用。
以重要作者身份在Science和Cell等国际期刊发文30余篇,总影响因子400多,总引用次数4800余次。
研究方向
免疫组库测序技术开发及其在自身免疫疾病、肿瘤、大健康领域的科研及应用
研究关键词
免疫组库(Immune repertoire, Rep-seq)、大数据(Big data)、生物信息(Bioinformatics)
代表性论著(10-20篇) 均为JCI 1区
1. Zhang Y, Yang X, Zhang Y, Zhang Y, Wang M, Ou JX, Zhu Y, Zeng H, Wu J, Lan C, Zhou HW, Yang W, Zhang Z. Tools for fundamental analysis functions of TCR repertoires: a systematic comparison. Brief Bioinform. 2020, 21(5):1706-1716
2. Sun J, Zhang Y, Wang M, Guan Q, Yang X, Ou JX, Yan M, Wang C, Zhang Y, Li ZH, Lan C, Mao C, Zhou HW, Hao B, Zhang Z. The Biological Significance of Multi-copy Regions and Their Impact on Variant Discovery. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2020, 18(5):516-524
3. Zhang Z, Wippo CJ, Wal M, Ward E, Korber P, Pugh BF. A packing mechanism for nucleosome organization reconstituted across a eukaryotic genome. Science. 2011, 332(6032):977-980
4. Zhang Z, Pugh BF. High-resolution genome-wide mapping of the primary structure of chromatin. Cell. 2011, 144(2):175-186
5. Wu X, Zhang Z, Schramm CA, Joyce MG, Kwon YD, Zhou T, Sheng Z, Zhang B, O'Dell S, McKee K, Georgiev IS, Chuang GY, Longo NS, Lynch RM, Saunders KO, Soto C, Srivatsan S, Yang Y, Bailer RT, Louder MK, NISC Comparative Sequencing Program, Mullikin JC, Connors M, Kwong PD, Mascola JR, Shapiro L. Maturation and Diversity of the VRC01-Antibody Lineage over 15 Years of Chronic HIV-1 Infection. Cell. 2015, 161(3):470-485
6. Schramm CA, Sheng Z, Zhang Z, Mascola JR, Kwong PD, Shapiro L. SONAR: A High-Throughput Pipeline for Inferring Antibody Ontogenies from Longitudinal Sequencing of B Cell Transcripts. Front Immunol. 2016, 7:372
代表性课题:
中共中央中组部 海外引进高层次人才经费 负责人 200万元
国家自然科学基金 基于大数据的中国人抗体组库量化新方法负责人 60万元
国家自然科学基金 创新研究群体项目-肾脏病学 子课题负责人200万元
广东省财政厅 珠江本土创新团队 骨干 200万元
学术任职:
中国生物工程学会生物信息学委员会 副主任委员
广东省生物信息学会 副理事长
广东省青年科学家协会 常务理事
执教课程(课程及教材建设)
高通量测序技术及应用
荣誉奖励
2014年 国家海外引进青年专家
2014年 广东省五四青年奖章