本实验室是广东省少数经国家发改委立项的BSL-3实验室之一（见《关于认定第一批国家高级别生物安全实验室的通知》(发改高技[2006]1587号)）。也是广东省反恐技术中心、广东省突发公共事件应急技术研究中心、广东省热带病研究重点实验室、广东省高校新发传染病防治重点实验室的重要组成部分，承担结核分枝杆菌、人类免疫缺陷病毒、高致病性流感病毒等引发传染病的卫生应急和防治任务，是广东省公安厅反恐指定的重大突发公共卫生事件应急备勤实验室。
本实验室为广东省预防医学会病原微生物与生物安全专业委员会副主任委员单位，开展过国家继续教育项目《生物恐怖与生物安全》，工作人员具有丰富的BSL-3实验室管理和实验操作经验，可保障本实验室生物安全。
发展经历
1998 年，南方医科大学三级生物安全实验室建立。
2000年，经国家卫生部批准启用，当时是华南地区规模最大、管理最规范的BSL-3实验室。
2012年，本实验室根据《实验室生物安全通用要求》等国家标准进行了改建。
代表性成果
- 2002至2003年SARS流行期间，我校从一开始就介入SARS病原学和流行病学研究，世界第一例尸解病人样品在本实验室完成前期处理、分装和检测工作，我国最先分离培养成功的SARS冠状病毒即来自于该实验室提供的尸解病人肺组织样品。
- 2003年，我校曾与复旦大学、广州医学院呼吸疾病研究所和香港大学联合成立的攻关组在这一实验室研制灭活SARS冠状病毒免疫预防滴鼻剂。
- 2004年，作为主要完成单位之一获得广东省科技进步特等奖“广东省传染性非典型肺炎（SARS）防治研究”。
代表性成果
- 2002至2003年SARS流行期间，我校从一开始就介入SARS病原学和流行病学研究，世界第一例尸解病人样品在本实验室完成前期处理、分装和检测工作，我国最先分离培养成功的SARS冠状病毒即来自于该实验室提供的尸解病人肺组织样品。
- 2003年，我校曾与复旦大学、广州医学院呼吸疾病研究所和香港大学联合成立的攻关组在这一实验室研制灭活SARS冠状病毒免疫预防滴鼻剂。
- 2004年，作为主要完成单位之一获得广东省科技进步特等奖“广东省传染性非典型肺炎（SARS）防治研究”。