职业卫生与职业医学系成立于2004年，现有博士生导师2名，硕士生导师3名，所有教师均具有博士学位。本系有分子生物学、细胞生物学、电生理学以及蛋白组学等实验室。在2004年转制地方前本学科是我军热环境医学唯一的专门研究机构。长期肩负着高温医学研究和培养该领域高层次人才的任务。从博士到大专5个层次的教学中形成了成熟的教学模式和系统的教学方法。迄今为止，已培养硕士46名，博士28名，博士后2名，海外硕士留学生3名。
本系的研究方向包括热应激、热损伤与热耐受的分子机制研究、Hsp90对氧化应激信号转导通路的调控作用研究、重金属的神经毒性机制、神经胶质瘤的乳腺癌的发生发展机制、帕金森病的信号转导信号机制和环境应激条件下炎性细胞的定向迁移机制研究，目前关注的热点为环境应激条件下的细胞信号转导通路，通过分子生物学、蛋白质组学和电生理学相结合的方法，探讨环境应激下的信号转导通路。
九五以来获国家及省部级各类课题41项，获军队科技进步一等奖1项、二等奖5项、三等奖4项、广东省科技进步三等奖1项、中华医学科技奖一等奖1项和广东省教学成果一等奖1项，制定国家军用标准1个(GJB1103-89)。编写和参编专著25部。发表科研论文200余篇，其中SCI论文78余篇。我系在转制之前是“全军军事预防医学重点学科”、“全军热带病研究重点实验室”、“全军2110工程重点建设学科”、“全军医学重中之重实验室” 的主要组成部分，2004年转制地方办学后，成为“广东省军事预防医学重点学科”、“广东省热带病研究重点实验室”和“公共卫生与预防医学一级学科博士点”的重要支撑实验室。